Mike Fukanaga pensava che gli scherzi dell'amico Owen Reynolds e la sua cotta per Amanda McKay sarebbero state le uniche sfide che avrebbe dovuto affrontare alle superiori. Si sbagliava...

Dopo la morte del nonno, Mike riceve una misteriosa lettera attraverso cui scopre di essere l'erede di una famiglia di ninja. Assieme a Owen e Amanda forma i Super Ninja, una squadra impegnata nella lotta al crimine. Ad allenare Mike e i suoi amici è l'ologramma del nonno...